Οπτική αντιπροσώπευση δεδομένων.

Abstract

Σκοπός της πτυχιακής αυτής ήταν η οπτική αντιπροσώπευση δεδομένων βιοπληροφορίας του προγράμματος αναπαράστασης βιολογικών δομών Jmol. Μέσω της οπτικής αντιπροσώπευσης δεδομένων του προγράμματος Jmol στόχος ήταν να επιτευχθεί η βελτίωση της διεπαφής χρήσης του προγράμματος. Το Jmol είναι ένα πρόγραμμα ανοικτού κώδικα που ανήκει στην κατηγορία του ανοικτού λογισμικού και ο κώδικας του είναι γραμμένος στην αντικειμενοστραφή γλώσσα προγραμματισμού Java .Για να επιτευχθεί η βελτιστοποίηση της οπτικής αντιπροσώπευσης δεδομένων του προϋπάρχοντος προγράμματος Jmol δημιουργήθηκαν νέα περιβάλλοντα πρός την κατεύθυνση αυτή ,τα οποία ενσωματώθηκαν στην εφαρμογή του ήδη υπάρχοντος προγράμματος Jmol. Τα νέα περιβάλλοντα που δημιουργήθηκαν γράφτηκαν σε γλώσσα προγραμματισμού Java ώστε να είναι απολύτως συμβατά με τον κώδικα του Jmol.Χρησιμοποιήθηκαν ιδιαίτερα στην ανάπτυξη τους τα πακέτα της Java Swing και Awt ,για την ανάπτυξη του περιβάλλοντος των παραθύρων της νέας εφαρμογής . Λόγω του γνωστικού αντικειμένου που πραγματεύεται η εφαρμογή που δημιουργήθηκε ,δηλαδή την παροχή πληροφορίας που αφορά βιολογικές δομές και μόρια, πριν αλλά και κατά την διάρκεια της πτυχιακής μελετήθηκαν διάφορες πληροφορίες σχετικά με της βιολογικές δομές και τους τρόπους που αναπαρίστανται. Μελετήθηκαν ακόμα προγράμματα που πραγματεύονται το ίδιο γνωστικό αντικείμενο με το πρόγραμμα Jmol ,ώστε τα περιβάλλοντα και οι εφαρμογές που θα δημιουργηθούν να καλύπτουν της επιμέρους ανάγκες ενός προγράμματος αναπαράστασης βιολογικών δομών. Τα περιβάλλοντα που δημιουργήθηκαν στο πλαίσιο της παρούσας πτυχιακής έχουν σαν αντικειμενικό στόχο την βελτίωση της διαδραστικότητας μεταξύ του προγράμματος και του χρήστη ,γι αυτό το λόγω το αποτέλεσμα είναι ,να είναι εύκολα και αποτελεσματικά στην χρήση τους με απλουστευμένες λειτουργίες και να παρέχουν ευελιξία στις ενέργειες του χρήστη μέσα από τα παρεχόμενα μενού .Τα περιβάλλοντα αυτά παρέχουν στον χρήστη ένα σύνολο πληροφοριών που είναι επικεντρωμένες στο γνωστικό αντικείμενο των βιολογικών δομών και μορίων και λειτουργίες ώστε ο χρήστης να έχει την δυνατότητα αλληλεπίδρασης με αυτήν την πληροφορία που του παρέχεται ,ο σκοπός που επιτυγχάνεται μέσο της αλληλεπίδρασης είναι ακριβώς η κατανόηση της πληροφορίας.

The aim of this exercise they was the optical representation of given biodata in the program of representation of biological structures Jmol.Via the optical representation of data of program Jmol,the aim was is achieved the improvement of contact of use of program. Jmol it is a program of open code that belong in the category of open software and his code is written in language of planning Java. In order to is achieved the optimisation of optical representation of data of program Jmol were created new environments to this direction that were incorporated in his application goods of existing program Jmol. The new environments that were created were written in language of planning Java so that they are also absolutely compatible with the code of Jmol , were particularly used in their growth her parcels Java Swing and Awt, for the growth of environment of windows of new application. For the reason of cognitive object that deals the application that created that is to say the benefit of information that concerns biological structures and molecules, before but also at the duration of final were studied different information with regard to biological structures and the ways that represented,Were still studied programs that they contain the same cognitive object with the program Jmol , in order that the environments and the applications that will be created they cover individual needs of program of representation of biological structures. The environments that were created in the frame of this exercise they have as objective aim the improvement of interaction between the program and the user, for this reason the result is,that is easily also effectively in their use with simplified operations and provide flexibility in actions of user in from provided menu. This environments provide in the user a total of information that is focus in the cognitive object of biological structures and molecules and operations in order that the user has the possibility of interaction with this information that for him is provided, the aim that is achieved means of interaction is precisely the comprehension of information.