Ανίχνευση γενετικής ποικιλομορφίας σε παραδοσιακές ποικιλίες αγγουριού με χρήση μοριακών δεικτών.

Abstract

Οι μοριακοί δείκτες θεωρούνται ως ένα αξιόπιστο εργαλείο για την ανίχνευση πολυμορφισμών της αλληλουχίας του DNA και την εξακρίβωση των γενετικών διαφορών οι οποίες θα μπορούσαν να οδηγήσουν στη διάκριση και κατοχύρωση των εμπορικών ποικιλιών σε σχέση με την περιγραφή των μορφολογικών χαρακτηριστικών. Τέτοιου είδους μελέτες έχουν γίνει σε διάφορα είδη φυτών όπως αυτά της οικογένειας Cucurbitaceae για την χαρτογράφηση του γονιδιώματος, την ανίχνευση της γενετικής ποικιλομορφίας, τον προσδιορισμό των φυλογενετικών σχέσεων και την ταυτοποίηση ποικιλιών. Για τον προσδιορισμό της γενετικής ποικιλομορφίας και των φυλογενετικών σχέσεων μεταξύ των φυτών, έχει χρησιμοποιηθεί μέχρι σήμερα μια πληθώρα τεχνικών που στηρίζονται στη μελέτη μορφολογικών, γενετικών και μοριακών χαρακτηριστικών. Για το σκοπό αυτό χρησιμοποιήθηκε και ένας μεγάλος αριθμός δεικτών όπως δείκτες πρωτεϊνών (Ισοένζυμα) και δείκτες νουκλεϊκών οξέων όπως τα RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) και τα RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA

In many regions of Greece, mostly the previous years, farmers cultivated traditional varieties (landraces), certain those characteristics that constitute usefully tools for the geneticists today, in order to incorporate desirable characteristics in plants with wide consumption. One of this plants is the cucumber, which presents explicit advantages than other plants, in regard to its culture and the usefulness that this demonstrates in genetic studies. The object of the present work was the detection of genetic diversity among the plants of the landrace Kalivia with the use of the RAPD molecular markers and the registration of qualitative phenotypical characteristics, aiming at the estimate of the genetic cleanliness of the variety and if this is reflected in the phenotype. For this aim, it was used DNA from 30 randomly selected plants for the molecular detection with RAPD, using 20 10-mer oligonucleotides with randomly sequence of noucleotides. Each DNA segment that was detected, constitutes an RAPD marker and all the plants were checked for the presence or absence of the markers. The morphological description of each plant separately included the following characteristics: Sex expression, powdery mildew resistance, bitterness, immature fruit color, mature fruit color, spine size, spine frequency, spine color, warted fruit and fruit skin gloss. The result of the RAPD molecular analysis showed that there was no divergence from absolute uniformity in the detected markers, some of which are specific for this concrete landrace and they could be used to distinguish it from other landraces with same or similar phenotypical expression. The morphological characteristics of the plants of this variety indicated high phenotypical uniformity between them. This agrees with the results of the RAPD molecular analysis and proves their high degree of genetic purity.