Αξιοποίηση της τεχνολογίας ISSR-PCR για την ανάδειξη γενετικής παραλλακτικότητας σε καλλιεργούμενα υβρίδια και ποικιλίες του γένους Cynodon.

Abstract

Το Cynodon dactylon (L.) Pers. είναι ένα θερμόφιλο γρασίδι που χρησιμοποιείται ευρέως για την παραγωγή ομοιόμορφου και υψηλής ποιότητας χλοοτάπητα, σε δημόσια πάρκα, κήπους κατοικιών, γήπεδα γκολφ και άλλων αθλημάτων. Μερικές από τις περισσότερο επιτυχημένες εμπορικά ποικιλίες αποτελούν υβρίδια μεταξύ των Cynodon dactylon X Cynodon transvaalensis. Υπάρχουν πολυάριθμες μέθοδοι για την ανάδειξη της γενετικής ποικιλομορφίας στο γρασίδι τύπου βερμούδας. Οι πιο συχνά χρησιμοποιούμενες είναι οι RAPDs, AFLPs, SRAP, DAF, SSR και ISSR. Στη παρούσα εργασία χρησιμοποιήθηκε νωπό φυτικό υλικό, από την ποικιλία «Tahoma» που καλλιεργείται στην Ελλάδα, την «Tahoma» που καλλιεργείται στην Ισπανία, την «Tifway 419» που καλλιεργείται στην Ελλάδα, και την «Monaco» που καλλιεργείται στην Ελλάδα, για να αναλυθεί η γενετική παραλλακτικότητα μεταξύ αυτών των 4 τεσσάρων ποικιλιών. Χρησιμοποιήθηκαν δώδεκα ISSR εκκινητές οι οποίοι ενίσχυσαν 327 τμήματα DNA από τα οποία τα 79 (23,8%) ήταν πολυμορφικά. Η ομαδοποίηση κατά UPGMA που έγινε στο πίνακα αλληλόμορφων χώρισε τους υπό έλεγχο γενότυπους σε τρεις κλάδους υποδεικνύοντας ότι η ποικιλία «Tahoma» με προέλευση από την Ελλάδα και την Ισπανία ήταν κατά 92% όμοιες, ενώ η ποικιλία «Tifway 419» χωρίστηκε από την «Tahoma», αν και τα δυο αυτά υβρίδια προέρχονται από όμοια φυτικά είδη. Ομοίως, η ποικιλία «Monaco» χωρίστηκε από τα υβρίδια των Cynodon dactylon x C. transvaalensis. Σύμφωνα με τα ευρήματα αυτής της μελέτης, οι Μοριακοί Δείκτες ISSR μπορούν να χρησιμοποιηθούν επιτυχώς για να διακρίνουμε υβρίδια και ποικιλίες του γένους Cynodon.

Cynodon dactylon (L.) Pers. is a warm-season turfgrass, originated from Middle East, and it is broadly used for public parks, golf courses, sports fields and home lawns. Some of the most commercially successful cultivars are interspecific hybrids between Cynodon dactylon x C. transvaalensis. There are numerous DNA profiling methods to detect genetic variation in bermudagrass. The most commonly used for this species are RAPDs, AFLPs, SRAP, DAF, SSR and ISSR. In the current study, fresh leaf tissue was collected from the cultivars ‘Tahoma’ originated from Greece, ‘Tahoma’ from Spain, ‘Tifway 419’ from Greece and ‘Monaco’ from Greece and used to isolate genomic DNA. The extracted DNA was subjected to ISSR-PCR methodology to analyze genetic diversity between these four cultivars. Twelve ISSR primers produced 327 bands of which 79 (23,8%) were polymorphic. Cluster analysis using the UPGMA method grouped the four cultivars into three clusters indicating that ‘Tahoma’ from Spain and Greece were 92% similar, while ‘Tifway 419’ was able to be separated from ‘Tahoma’ even though both hybrids originate from similar parental plant species. Similarly, ‘Monaco’ was clearly distinguished from the C. dactylon x C. transvaalensis hybrids. Based on the findings of the current research, ISSR markers could successfully be utilized as a method to distinguish Cynodon hybrids and varieties.